V Manuscriptoriu naleznete digitalizovaný obsah z 29 (nejen evropských) zemí:
| 1. Arménie | 11. Kazachstán | 21. Slovensko |
| 2. Belgie | 12. Litva | 22. Slovinsko |
| 3. Bělorusko | 13. Maďarsko | 23. Spojené státy americké |
| 4. Bulharsko | 14. Moldávie | 24. Srbsko |
| 5. Česká republika | 15. Německo | 25. Španělsko |
| 6. Dánsko | 16. Polsko | 26. Švédsko |
| 7. Finsko | 17. Portugalsko | 27. Švýcarsko |
| 8. Francie | 18. Rakousko | 28. Turecko |
| 9. Island | 19. Rumunsko | 29. Ukrajina |
| 10. Itálie | 20. Rusko |
Obsah Manuscriptoria můžete procházet mj. právě po těchto zemích a jednotlivých institucích, kterých je v současné době více než 200 (níže každá z nich vede na souhrnný výsledek v našem katalogu):
Arménie
| Jerevan | Národní knihovna Arménie (Հայաստանի Ազգային գրադարան) |
Belgie
| Bruggy | Veřejná knihovna v Bruggách (Openbare Bibliotheek Brugge) |
Bělorusko
| Minsk | Národní knihovna Běloruska (Нацыянальная бібліятэка Беларусі) |
Bulharsko
| Plovdiv | Národní knihovna Ivana Vazova (Народна библиотека „Иван Вазов“) |
Česká republika
Dánsko
| Kodaň | Kodaňská univerzita – Ústav severských studií a lingvistiky (Københavns Universitet – Institut for Nordiske Studier og Sprogvidenskab) |
Finsko
| Helsinky | Národní knihovna Finska (Kansalliskirjasto) |
Francie
| Mylhúzy | Městské knihovny v Mylhúzách (Bibliothèques municipales de Mulhouse) | |
| Paříž | Národní knihovna Francie (Bibliothèque nationale de France) |
Island
| Reykjavík | Institut Árniho Magnússona pro islandská studia (Stofnun Árna Magnússonar í íslenskum fræðum) | |
| Reykjavík | Národní a univerzitní knihovna Islandu (Landsbókasafn Íslands – Háskólabókasafn) | |
| Sauðárkrókur | Okresní archiv Skagfjörður (Héraðsskjalasafn Skagfirðinga) |
Itálie
| Florencie | Národní ústřední knihovna ve Florencii (Biblioteca Nazionale Centrale di Firenze) |
Kazachstán
| Almaty | Národní knihovna Republiky Kazachstán (Қазақстан Республикасының Ұлттық Кiтапханасы) |
Litva
| Vilnius | Litevská národní knihovna Martyna Mažvyda (Lietuvos nacionalinė Martyno Mažvydo biblioteka) | |
| Vilnius | Univerzitní knihovna ve Vilniusu (Vilniaus universiteto biblioteka) | |
| Vilnius | Wróblewského knihovna Litevské akademie věd (Lietuvos mokslų akademijos Vrublevskių biblioteka) |
Maďarsko
| Budapešť | Széchényiho národní knihovna (Országos Széchényi Könyvtár) | |
| Budapešť | Technická a ekonomická univerzita v Budapešti (Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem) | |
| Budapešť | Univerzitní knihovna (ELTE) (ELTE Egyetemi Könyvtár) |
Moldavsko
| Kišiněv | Národní knihovna Moldavské republiky (Biblioteca Naţională a Republicii Moldova) |
Německo
| Heidelberg | Univerzitní knihovna (Universitätsbibliothek) | |
| Kolín nad Rýnem | Arcibiskupská diecézní a katedrální knihovna (Erzbischöfliche Diözesan- und Dombibliothek Köln) | |
| Kolín nad Rýnem | Univerzitní a městská knihovna Kolín nad Rýnem (Universitäts- und Stadtbibliothek Köln) | |
| Norimberk | Germánské národní muzeum (Germanisches Nationalmuseum) | |
| Stuttgart | Württemberská zemská knihovna (Württembergische Landesbibliothek) | |
| Überlingen | Leopoldova a Sofiina knihovna (Leopold-Sophien-Bibliothek) | |
| Wolfenbüttel | Knihovna vévody Augusta (Herzog August Bibliothek) |
Polsko
| Bydhošť | Vojvodská a městská veřejná knihovna v Bydhošti (Wojewódzka i Miejska Biblioteka Publiczna w Bydgoszczy) | |
| Grudziądz | Městská knihovna Wiktora Kulerského (Biblioteka Miejska im. Wiktora Kulerskiego) | |
| Krakov | Jagellonská knihovna (Biblioteka Jagiellońska) | |
| Pelplin | Diecézní knihovna biskupa Jana Bernarda Szlagi (Biblioteka Diecezjalna im. Biskupa Jana Bernarda Szlagi) | |
| Toruň | Univerzitní knihovna v Toruni (Biblioteka Uniwersytecka w Toruniu) | |
| Toruň | Vojvodská veřejná knihovna – Koperníkova knihovna v Toruni (Wojewódzka Biblioteka Publiczna – Książnica Kopernikańska w Toruniu) | |
| Varšava | Polská národní knihovna (Biblioteka Narodowa) | |
| Vratislav | Univerzitní knihovna ve Vratislavi (Biblioteka Uniwersytecka we Wrocławiu) | |
| Zelená Hora | Univerzitní knihovna (Biblioteka Uniwersytecka) |
Portugalsko
| Lisabon | Národní knihovna Portugalska (Biblioteca Nacional de Portugal) |
Rakousko
| Lilienfeld | Klášter cisterciáků Lilienfeld (Zisterzienserstift Lilienfeld) | |
| Sankt Paul im Lavanttal | Knihovna kláštera sv. Pavla (Stiftsbibliothek) | |
| Sankt Pölten | Diecézní archiv v Sankt Pöltenu (Diözesanarchiv St. Pölten) | |
| Vídeň | Rakouský státní archiv (Österreichisches Staatsarchiv) |
Rumunsko
| Alba Iulia | Knihovna Batthyaneum – pobočka Národní knihovny Rumunska (Biblioteca Batthyaneum – Filială a Bibliotecii Naţionale a României) | |
| Brašov | Župní knihovna George Bariţiu (Biblioteca Judeţeană „George Bariţiu“ Braşov) | |
| Bukurešť | Národní knihovna Rumunska (Biblioteca Națională a României) |
Rusko
| Moskva | Ruská státní knihovna (Российская государственная библиотека) | |
| Moskva | Všeruská státní knihovna zahraniční literatury M. I. Rudomino (Всероссийская государственная библиотека иностранной литературы имени М.И.Рудомино) | |
| Nižnij Novgorod | Nižněnovgorodská státní oblastní všeobecná vědecká knihovna V. I. Lenina (Нижегородская государственная областная универсальная научная библиотека им. В.И. Ленина) | |
| Novosibirsk | Státní veřejná vědeckotechnická knihovna Sibiřského oddělení Ruské akademie věd (Государственная публичная научно-техническая библиотека Сибирского отделения Российской академии наук) | |
| Petrohrad | Ruská národní knihovna (Российская национальная библиотека) | |
| Petrohrad | Vědecká knihovna M. Gorkého Petrohradské státní univerzity (Научная библиотека имени М. Горького Санкт-Петербургского государственного университета) | |
| Sergijev Posad | Trojicko-sergijevská lávra (Свято-Троицкая Сергиева Лавра) | |
| Tomsk | Vědecká knihovna Tomské státní univerzity (Научная библиотека Томского государственного университета) |
Slovensko
| Banská Bystrica | Státní vědecká knihovna v Banskej Bystrici (Štátna vedecká knižnica v Banskej Bystrici) | |
| Bratislava | Univerzitní knihovna v Bratislavě (Univerzitná knižnica v Bratislave) | |
| Bratislava | Ústřední knihovna Slovenské akademie věd (Ústredná knižnica Slovenskej akadémie vied) | |
| Kežmarok | Lycejní knihovna (Lyceálna knižnica) |
Slovinsko
| Lublaň | Národní a univerzitní knihovna (Narodna in univerzitetna knjižnica) |
Spojené státy americké
| Chicago | Knihovna Newberry (Newberry Library) | |
| Cleveland | Muzeum umění v Clevelandu (The Cleveland Museum of Art) | |
| Filadelfie | Knihovny Pensylvánské univerzity – Kislakovo centrum pro speciální kolekce, vzácné knihy a rukopisy (Penn Libraries – Kislak Center for Special Collections, Rare Books and Manuscripts) | |
| Tallahassee | Knihovny Floridské státní univerzity (Florida State University Libraries) | |
| Washington, D.C. | Muzeum Bible (Museum of the Bible) |
Srbsko
| Bělehrad | Národní knihovna Srbska (Народна библиотека Србије) | |
| Bělehrad | Univerzitní knihovna Svetozara Markoviće (Универзитетска библиотека „Светозар Марковић“) |
Španělsko
| Madrid | Královská knihovna – Patrimonio Nacional (Real Biblioteca – Patrimonio Nacional) | |
| Madrid | Národní knihovna Španělska (Biblioteca Nacional de España) | |
| Madrid | Univerzita Complutense v Madridu (Universidad Complutense de Madrid) |
Švédsko
| Lund | Univerzitní knihovna (Universitetsbiblioteket) | |
| Stockholm | Národní knihovna Švédska (Kungliga biblioteket) |
Švýcarsko
| Aarau | Knihovna kantonu Aargau (Aargauer Kantonsbibliothek) | |
| Aarau | Státní archiv kantonu Aargau (Staatsarchiv Aargau) | |
| Appenzell | Zemský archiv kantonu Appenzell Innerrhoden (Landesarchiv Appenzell Innerrhoden) | |
| Basilej | Muzeum farmacie Univerzity v Basileji (Pharmaziemuseum der Universität Basel) | |
| Basilej | Státní archiv kantonu Basilej-město (Staatsarchiv Basel-Stadt) | |
| Basilej | Univerzitní knihovna v Basileji (Universitätsbibliothek Basel) | |
| Bern | Veřejná knihovna v Bernu (Burgerbibliothek Bern) | |
| Beromünster | Klášterní kostel sv. Michaela (Stiftskirche St. Michael) | |
| Bever | Obecní archiv (Dorfarchiv) | |
| Bremgarten | Městský archiv v Bremgartenu (Stadtarchiv Bremgarten) | |
| Bulle | Muzeum okresu Gruyère (Musée gruérien) | |
| Burgdorf | Městská knihovna v Burgdorfu (Stadtbibliothek Burgdorf) | |
| Castro | Farní archiv (Archivio parrocchiale) | |
| Chavannes-près-Renens | Archiv kantonu Vaud (Archives cantonales vaudoises) | |
| Chironico | Farní archiv (Archivio parrocchiale) | |
| Chur | Státní archiv kantonu Graubünden (Staatsarchiv Graubünden) | |
| Claro | Farní archiv (Archivio parrocchiale) | |
| Cologny | Nadace Martina Bodmera (Fondation Martin Bodmer) | |
| Curych | Sbírka Reného Braginského (Braginsky Collection) | |
| Curych | Švýcarské národní muzeum (Schweizerisches Nationalmuseum) | |
| Curych | Ústřední knihovna (Zentralbibliothek) | |
| Dalpe | Farní archiv (Archivio parrocchiale) | |
| Delémont | Muzeum umění a historie kantonu Jura (Musée Jurassien d’Art et d’Histoire) | |
| Disentis | Románská knihovna kláštera v Disentisu (Romanische Bibliothek des Klosters Disentis) | |
| Einsiedeln | Knihovna kláštera v Einsiedelnu (Stiftsbibliothek) | |
| Engelberg | Knihovna kláštera v Engelbergu (Stiftsbibliothek) | |
| Estavayer-le-Lac | Farnost sv. Vavřince (Paroisse St-Laurent Estavayer) | |
| Faido | Farní archiv (Archivio parrocchiale) | |
| Flawil | Obec Flawil (Gemeinde Flawil) | |
| Frauenfeld | Katolický farní archiv ve Frauenfeldu (Katholisches Pfarrarchiv Frauenfeld) | |
| Frauenfeld | Knihovna kantonu Thurgau (Kantonsbibliothek Thurgau) | |
| Frauenfeld | Muzeum historie kantonu Thurgau (Historisches Museum Thurgau) | |
| Fribourg | Kantonální a univerzitní knihovna (Bibliothèque cantonale et universitaire/Kantons- und Universitätsbibliothek) | |
| Fribourg | Klášter františkánů (Couvent des Cordeliers/Franziskanerkloster) | |
| Fribourg | Státní archiv kantonu Fribourg (Archives de l´État Fribourg/Staatsarchiv Freiburg) | |
| Hermetschwil | Klášter benediktinek sv. Martina (Benediktinerinnenkloster St. Martin) | |
| Lausanne | Kantonální a univerzitní knihovna v Lausanne (Bibliothèque cantonale et universitaire – Lausanne) | |
| Lucern | Korporace Lucern (Korporation Luzern) | |
| Lucern | Provinciální archiv švýcarských kapucínů v Lucernu (Provinzarchiv Schweizer Kapuziner Luzern) | |
| Lucern | Státní archiv kantonu Lucern (Staatsarchiv Luzern) | |
| Lucern | Ústřední a univerzitní knihovna (Zentral- und Hochschulbibliothek) | |
| Mairengo | Farní archiv (Archivio parrocchiale) | |
| Mariastein | Klášter benediktinů v Mariasteinu (Benediktinerkloster Mariastein) | |
| Müstair | Klášter benediktinek sv. Jana (Benediktinerinnenkloster St. Johann) | |
| Neuchâtel | Veřejná a univerzitní knihovna v Neuchâtelu (Bibliothèque publique et universitaire de Neuchâtel) | |
| Orselina | Klášter Madonna del Sasso (Convento della Madonna del Sasso) | |
| Porrentruy | Archiv kantonu Jura (Archives cantonales jurassiennes) | |
| Porrentruy | Knihovna kantonu Jura (Bibliothèque cantonale jurassienne) | |
| Quinto | Farní archiv (Archivio parrocchiale) | |
| Romont | Opatství Fille-Dieu (Abbaye de la Fille-Dieu) | |
| Saint-Imier | Mémoires d’Ici – Výzkumné a dokumentační centrum Bernského Jury (Mémoires d’Ici – Centre de recherche et de documentation du Jura bernois) | |
| Saint-Maurice | Opatství sv. Mořice (Abbaye de Saint-Maurice) | |
| Samedan | Chesa Planta (Chesa Planta) | |
| Sarnen | Klášter benediktinů (Benediktinerkollegium) | |
| Sarnen | Státní archiv kantonu Obwalden (Staatsarchiv Obwalden) | |
| Schaffhausen | Archiv společnosti Georg Fischer (Konzernarchiv der Georg Fischer AG) | |
| Schaffhausen | Městská knihovna (Stadtbibliothek) | |
| Schaffhausen | Státní archiv (Staatsarchiv) | |
| Schlatt | Železná knihovna (Eisenbibliothek) | |
| Sils im Engadin/Segl | Obecní archiv (Dorfarchiv) | |
| Sion | Katedrální kapitula v Sionu (Chapitre de la Cathédrale de Sion/Domkapitel der Kathedrale von Sitten) | |
| Sion | Mediatéka kantonu Valais (Médiathèque Valais/Mediathek Wallis) | |
| Sion | Státní archiv kantonu Valais (Archives de l’Etat du Valais/Staatsarchiv Wallis) | |
| Solothurn | Poklad katedrály sv. Ursa (Domschatz der Kathedrale St. Ursen) | |
| Solothurn | Státní archiv kantonu Solothurn (Staatsarchiv Solothurn) | |
| Solothurn | Ústřední knihovna kantonu Solothurn (Zentralbibliothek Solothurn) | |
| St. Gallen | Archiv opatství Pfäfers (Stiftsarchiv – Abtei Pfäfers) | |
| St. Gallen | Kantonální knihovna Vadiana (Kantonsbibliothek Vadiana) | |
| St. Gallen | Knihovna kláštera sv. Havla (Stiftsbibliothek St.Gallen) | |
| St. Gallen | Městský archiv v St. Gallen (Stadtarchiv der Ortsbürgergemeinde St. Gallen) | |
| Steinhausen | Lesní družstvo ve Steinhausenu (Waldgenossenschaft Steinhausen) | |
| Tesserete | Farní archiv (Archivio parrocchiale) | |
| Trogen | Knihovna kantonu Appenzell Ausserrhoden (Kantonsbibliothek Appenzell Ausserrhoden) | |
| Urnäsch | Obecní archiv (Gemeindearchiv) | |
| Vevey | Historické muzeum ve Vevey (Musée historique de Vevey) | |
| Wädenswil | Dokumentační centrum Horního Curyšského jezera (Dokumentationsstelle Oberer Zürichsee) | |
| Wattwil | Klášter Panny Marie Andělské (Kloster St. Maria der Engel) | |
| Wil | Klášter dominikánek sv. Kateřiny (Dominikanerinnenkloster St. Katharina) | |
| Zofingen | Městská knihovna (Stadtbibliothek) | |
| Ženeva | Barbier-Muellerova nadace pro studium italské renesanční poezie (Fondation Barbier-Mueller pour l’étude de la poésie italienne de la Renaissance) | |
| Ženeva | Botanická zahrada v Ženevě (Conservatoire et Jardin botaniques de Genève) | |
| Ženeva | Ženevská knihovna (Bibliothèque de Genève) | |
| Ženeva | Židovská knihovna Gérarda Nordmanna (Bibliothèque juive « Gérard Nordmann ») |
Turecko
| Ankara | Národní knihovna Turecka (Millî Kütüphane) |
Ukrajina
| Oděsa | Národní vědecká knihovna v Oděse (Одеська національна наукова бібліотека) | |
| Oděsa | Vědecká knihovna Oděské národní univerzity I. I. Mečnikova (Наукова бібліотека Одеського національного університету імені І.І. Мечникова) |
